Genetički diverzitet patogenih izolata Pseudomonas syringae sa šećerne repe na teritoriji AP Vojvodina

Abstract

Pseudomonas syringae predstavlja jednog od najrasprostranjenijih i najinvazivnijih biljnih patogena na svetu, koji izaziva različite tipove bolesti na velikom opsegu domaćina i može se prilagoditi različitim tipovim staništa.1 Tokom 2013. godine na komercijalnim zasadima šećerne repe na teritoriji AP Vojvodine detektovana je bolest lisne pegavosti uzrokovana ovim fitopatogenom.2 Cilj ovog istraživanja je bio molekularna karakterizacija kolekcije izolata P. syringae izolovanih sa zaraženih listova šećerne repe, kao i utvrđivanje genetičkog diverziteta ovog patogena na teritoriji AP Vojvodine. Prikupljeni izolati podvrgnuti su metodama genetičkog profilisanja (rep-PCR i PFGE), kao i analizi sekvenci više različitih genskih lokusa (MLSA).3 Na osnovu repPCR izdvojeno je 25 različitih profila, čiji su reprezentativni predstavnici uključeni u dalja istraživanja. Upotrebom PFGE metode detektovan je izuzetno veliki intraspecijski diverzitet, sa čak 17 različitih genetičkih profila. Analiza sekvenci gyrB i gapA gena izdvojila je 4, odnosno 3 različite alelske varijante. Utvrđena genetička heterogenost ukazuje na to da je diverzitet P. syringae izuzetno veliki, da infekcija šećerne repe nije klonalna i da postoje najmanje tri različite linije infekcije. Karakterizacija izolata i utvrđivanje genetičkog diverziteta predstavlja prvi korak u dostizanju dalekosežnih ciljeva, kao što su ispravno upravljanje merama kontrole patogena i detektovanje potencijalnih izvora infekcije.