Stvaranje kapaciteta za nadzor biljnih patogena: Razvijanje qPCR testova za detekciju P. syringae pv. aptata patogena šećerne repe


Project title
Stvaranje kapaciteta za nadzor biljnih patogena: Razvijanje qPCR testova za detekciju P. syringae pv. aptata patogena šećerne repe
Project Coordinator
Participant Organization(s)
 
Status
Completed
Start date
01-01-2023
Expected Completion
31-12-2024
 
Abstract
Biljni patogeni predstavljaju jednu od najvećih pretnjni za stabilnu proizvodnju hrane, kao i održivi menadžment poljoprivrednih površina. Jedan od glavnih oslonaca u očuvanju biljnog zdravlja je razvoj sveobuhvatnog nadzora, gde je ključni deo razvoj brzih i preciznih alata za detekciju patogena. Paradajz predstavlja drugu najznačajniju poljoprivredna kulturu na svetskom nivou i jednu od najvažnijih poljoprivrednih kultura u okviru Evropske unije, dok Srbija i Francuska predstavljaju sedmog i osmog proizvođača paradajza među prvih 25 zemalja u Evropi. Clavibacter michiganensis subs. michiganensis (Cmm) se smatra jednim od najznačajnijih bakterijskih patogena paradajza, koji prouzrokuje bakterijski kancer u zasadima širom sveta, uključujući Francusku i Srbiju, uzrokujući nepredvidive epidemije bolesti, dok su strategije njegove kontrole ograničene. Glavni cilj projekta je napraviti osnovu za praćenje zdravlja biljaka kroz in situ detekciju bolesti primenom brzih i jednostavnih molekularno-bioloških alata baziranih na izotermnoj amplifikaciji posredstvom petlje (engl. Loop‐mediated isothermal amplification - LAMP). Projekat će obezbediti značajne terenske podatke o primenljivosti ovih testova za i) ranu detekciju i eliminaciju primarnog izvora zaraze i inficiranih biljaka, ii) testiranje uspešnosti mera dezinfekcije i prisutnosti patogena na inertnim površinama, i iii) realizaciju LAMP testova na terenu tokom mera prevencije i biološke kontrole. Validacija LAMP testova za detekciju Cmm, koji će biti korišćeni u obe laboratorije i na lokalnim usevima paradajza, će pojačati profilaktičke mere protiv bolesti bakterijskog kancera, u cilju ograničavanja epidemija i ekonomskih gubitaka prinosa.